Fakultas Pertanian Universitas Alwashliyah didirikan pada tahun 2003 berdasarkan surat pertimbangan dari Ditjen Pendidikan Tinggi No. 1767/D2.2/2003 tanggal 2 September 2003 izin program studi diberikan yaitu program studi Agronomi jenjang program sarjana (S1) dan Ilmu Tanah jenjang program sarjana (S1). Selanjutnya Fakultas Pertanian Universitas Alwashliyah medan diberi izin penyelenggaraan program studi agribisnis (S1) berdasarkan SK Departemen Perguruan Tinggi Nasional dengan SK No. 1109/D/T/2004. Pada Tahun 2010 berdasarkan surat keputusan Kementerian Pendidikan Nasional Koordinasi Perguruan Tinggi Swasta Wilayah – 1 memberikan surat keputusan perpanjangan izin Program Studi Agroteknologi Jenjang S1.
Setelah tim terbentuk dan pembagian tugas kepada masing-masing anggota. Mulai saat itu tim yang dibentuk mulai menyusun dan mencari bahan-bahan yang di perlukan, baik tentang kurikulum, tenaga dosen, dan data-data perkembangan lainnya. Akhirnya pada Tahun 2004 proposal FP-UNIVA selesai dan dikirimkan ke Jakarta oleh Rektor.
Pada dasarnya ada 2 (dua) Program Studi yang disusun di dalam Proposal yaitu:
1. Program Studi Agroteknologi (Jenjang pendidikan S1)
2. Program Studi Agribisnis (Jenjang pendidikan S1)
Dengan izin dari Kementrian Nasional melalui Direktur Jenderal Pendidikan Tingg Nomor : 006/D/T/2004 Tanggal 2 Januari 2004 Prihal : Ijin Penyelenggaraan Program-Program Studi baru pada UNIVA Medan.